Ну, не знаю можно ли это называть почтовыми клиентами - на ЯндексПочте-это что, почтовый клиент?
Да. Есть MTA - Mail Transport Agent, а есть MUA - Mail User Agent. MUA - это и есть в просторечии почтовый котент.
В плане кодировок в Internet Explorer -> Вид -> Кодировка и выбирай, какую хочешь. Но знаки вопроса все равно остаются, как будто на них это не действует.
И не должно. Как я понял, путь движения бвл такой:
1. Письмо написано в ISO-8859-1
2. Письмо отправлено без искажений
3. Письмо принято без искажений
4. При ответе символы заменены на вопросы
5. Письмо отправлено с вопросами.
6. Письмо получено с вопросами.
Надо своего клиента настраивать правильно, чтобы исходящая почта была в нужной кодировке.